Na het opstappen van Anne-Lize van der Stoel uit het Dagelijks Bestuur ziet de fractie toch goede kansen het programakkoord met de PvdA en VVD met vernieuwd elan uit te voeren. In geen geval is haar vertrek wat GroenLinks betreft aanleiding voor een breuk met coalitiepartij VVD.
Het akkoord dat de drie partijen in april 2006 sloten biedt goede perspectieven op doorgaande samenwerking tussen deze partijen. GroenLinks beschouwt het ontstaan van de huidige situatie als de uitkomst van het voornemen van de drie collegepartijen zich een nieuwe bestuursstijl eigen te maken. GroenLinks pleitte bij de onderhandelingen voor een open en transparante bestuursstijl waarbij het stadsdeel streeft naar een goed contact tussen burger, raad en dagelijks bestuur. Ook PvdA en VVD onderschreven dit voor stadsdeel, burger en ondernemer belangrijke onderwerp.
Voor Van der Stoel is haar vertrek een persoonlijk drama. GroenLinks betreurt dat. Ondanks haar vertrek zien wij echter goede mogelijkheden het onderlinge vertrouwen in de coalitie te herstellen en het programakkoord van PvdA, GroenLinks en VVD uit te voeren.